Este modelo plantea que el Centromero ha
evolucionado pero en un principio fue el
primer Sistema Biológico de Transcripción
Inversa que junto a una Telomerasa leía los
ordenadores libres como ARN transformándolo en ADN mono
catenario uniéndolos uno a uno
para formar lo que fue en un
inicio el esqueleto primario de
los cromosomas.
A mi entender, la doble hélice
(COMPLEMENTARIEDAD) fue un hallazgo evolutivo necesario que
le permitió a la célula por un lado lograr la
división de una cantidad de información
genética cada vez más grande de manera
relativamente fácil y eficaz y por el otro la posibilidad
de poder diferenciar las células como lo veremos
más adelante.
Cronológicamente hablando el modelo
plantea que en la formación de los cromosomas se
distinguen dos tiempos:
-primer tiempo: en este se incorporaron los
ordenadores en sentido
centromero-telomero.
-segundo tiempo: los ordenadores
además del sentido centromero-telomero se incorporaron en
sentido telomero-centromero y funcional mente estaban
relacionados con la diferenciación celular. En este tiempo
ya debió existir en el medio que circundaba los
ordenadores ademas de enzimas con acción transcriptasa
inversa y ADN polimerasa, enzimas de corte y empalme de ADN entre
otras.
¿Porque 23 cromosomas
somáticos y uno sexual?
Es posible que esto fue determinado
espontáneamente como una forma de sector izar y
poder hacer funcional los distintos programas de
aplicación. Estos llegaban como ordenadores a
través de los virus al CCER, estas al incorporarlos a los
cromosomas utilizaban la SECUENCIA DE RECONOCIMIENTO DE
PROCEDENCIA, y muy probablemente, varios cromosomas
posibilitarían sector izar los ordenadores por procedencia
facilitando el trabajo de creación del sistema
operativo.
¿Cómo estaría organizado
un ordenador ideal en nuestro modelo?
Un ORDENADOR entre su Bi y Bf al ser
almacenado como ADN puede presentar dos zonas:
1-ZONA REGULATORIA: constituida por la
secuencia A y secuencia B.
2-ZONA EJECUTORIA: constituida por la
secuencia C y la secuencia D.
Bi/——A——-//—–B——/————–C——————-/—-D—-/Bf
Bi/——-zona regulatoria —
/————-zona ejecutoria————–/Bf
A: secuencia de bases de RECONOCIMIENTO del
ordenador.
B: secuencia de bases de activación
del ordenador. Si B no existe el ordenador esta
inhabilitado.
C: secuencias de bases de ejecución
del ordenador. Esta secuencia codifica las ordenes que porta el
ordenador. Solo serán ejecutadas si el ordenador es
transcrito.
D: secuencia de bases de final del
ordenador. Esta secuencia codifica el final de la
transcripción del ordenador.
Ley genética: todos los ordenadores
del ADN tienen en su otra hebra el ordenador
complementario.
ORDENADOR
BIOLÓGICO: ordenador mas ordenador
complementario.
Analicemos las posibles secuencias en un
ORDENADOR IDEAL:
ZONA REGULATORIA DE UN
ORDENADOR:
A: es una secuencia finita de bases
nitrogenadas que sirven de reconocimiento del ordenador por parte
de otro ordenador.
Esta secuencia estaría dividida
en:
A:
/——-A1——/————A2———————–/
A1: secuencia de reconocimiento de
especie.
A2: secuencia de reconocimiento de cluster.
Ley genética:
1- A jamas se transcribe.
2- No todos los ordenadores del genoma
humano deben comenzar con A1. Pero si todos los ordenadores no
ejecutables del CBM comienzan con A1.
3- Un cluster biológico esta formado
por todos aquellos ordenadores que tienen igual A2.
4- dos ordenadores homólogos del CBM
poseen igual A.
5- Cuando hablamos de zona de
reconocimiento de un ordenador NO hablamos de CODONES ya que el
numero de bases podría ser distinto de 3 y no
necesariamente múltiplo de 3.
B: es una secuencia de bases de
ACTIVACIÓN del ordenador.
– ORDENADOR INHABILITADO: no presenta la
secuencia B
– ORDENADOR ACTIVO: presenta la secuencia
B.
Ley genética: que el ordenador
este activo no significa que sera transcrito. Para que ello
ocurra la secuencia de B deberá estar expuesta a la red
química al sistema biológico
transcripcional.
En nuestro modelo la Zona Regulatoria
tendrá dos COMANDOS:
COMANDO INTELIGENTE: dado por la secuencia
A1-A2. Sirve de reconocimiento del ordenador por parte de otro
ordenador.
COMANDO TRANSCRIPCIONAL: dado por la
secuencia B. Esta secuencia al estar expuesta a la red
química es reconocida por los factores de
transcripción.
ZONA EJECUTORIA DEL ORDENADOR:
/———-B——–//————————————C————————/–D—Bf
B: en la secuencia de bases B se encuentra
el PROMOTOR que al estar expuesto a la red
química permite que los FACTORES DE
TRANSCRIPCIÓN sean activados generándose una
secuencia de múltiples ensambles entre ellos, al
finalizar, queda todo listo para que la ARN
polimerasa ingrese, reconozca una secuencia de bases y
comience la transcripción.
En nuestro modelo llamaremos SISTEMA
BIOLÓGICO TRANSCRIPCIONAL (SBT) a los FACTORES DE
TRANSCRIPCIÓN (FT) + ARN POLIMERASA
(ARNp).
C: es una secuencia finita de bases
nitrogenadas del ordenador que al ser transcrita por las
ARNp y volcado el producto de transcripción ARNm
inmaduro a la red química hace que se genere
una orden.
El ARNm inmaduro en la red química
sufrirá un proceso de maduración a través
del Mecanismo Genético de
Splicing produciéndose una o mas moléculas
de ARNm funcional el cual se encargara de ejecutar la
orden.
D: es una secuencia finita de bases que
produce la finalizacion de la transcripción. La secuencia
de D tendrá, entre otros, uno de estos tres codones
ATT, ATC o ACT. Cualquiera de estos sera reconocido por el ARNt
para detener la síntesis proteica
La secuencia de bases C puede presentar dos
zonas:
//————————-E——————–/———————-G——————-/
1-E: zona NO GEN
Esta zona podría estar formada por
dos secuencias distintas:
E1: secuencia finita de bases que
serviría para reconocer ordenadores. ARNi de
reconocimiento.
E2: secuencia finita de bases que al ser
transcrito por la ARNp generaría un ARNm que post
Splicing podría actuar sobre una secuencia anterior al
Promotor de otro ordenador activando o frenando la
transcripción. ARNi regulación de
transcripción.
2-G: zona GEN
/-Go-/——-Ge———–/——-Gi——-/—–Ge——-/——-Gi——-/—-Ge——–/
Go: codon que reconoce el ARNt para
comenzar la síntesis proteica- Secuencia TAC.
Ge: secuencia de codones que codifican la
cadena polipeptidica. Serian los Exones.
Gi: secuencia de base nitrogenadas que
forman los Intrones. Estos no codifican cadena
polipeptidica.
La zona G estaría formada por una
secuencia de exones e intrones
/-Go-/exones-intrones-exones-intrones–/—-Gv—-/Go-/exones-intrones-exones-/
/-Go-/—————————G1———–/—-Gv—-/Go-/——–G2—————–/
Gv: secuencia de bases que es tomada por la
ARNp como una zona vinculante, no deteniendo la
transcripción. En este caso el ARNm inmaduro tendrá
el gen G1 y el gen G2.
Un ordenador podría tener en la zona
gen varias secuencias vinculantes.
¿Qué es en nuestro modelo
un Clúster Biológico?
Cluster biológico: es un conjunto
finito de múltiples ordenadores con igual A2 unidos por
una red química de alta velocidad de forma tal que
el conjunto es visto como un único ordenador.
Cada Cluster Biológico contiene las
ordenes necesarias para manifestar una función o hecho
especifico y puntual.
Cada Cluster Biológico puede recibir
o generar ordenes.
Puede recibir ordenes de Activación
o Inhabilitacion de los ordenadores.
Puede generar ordenes de activación
o inhabilitacion de ordenadores o generar síntesis de
proteínas.
Clasificación de los Cluster
Biológicos:
1- CLUSTER BIOLÓGICOS NO
EJECUTABLES: cuando son transcritos la orden genera solo efecto a
nivel de ordenadores.
¿Como fueron
concebidos?
Estos cluster fueron concebidos en el CCER
y probados y re adaptados para ser funcionales en la
Célula Reproductora.
Estos Cluster van surgiendo a medida que
van llegando al CCER los virus conteniendo los ordenadores que
van surgiendo de los distintos Programas de Aplicación
creados por los distintos clones celulares que se van
diferenciando dentro del CCES.
Los ordenadores que portan los virus
deberían tener en primera instancia dos zonas bien
diferenciadas en su secuencia:
Supongamos ahora un virus que porta un
ordenador cualquiera:
– Una zona debería indicarle al CCER
la procedencia del ordenador, es decir, a través de
esta secuencia el CCER podría reconocer y agrupar en
bloques, en un área de un cromosoma, la información
genética recibida de un clon X de
células del CCES en proceso de
diferenciación.
– Y otra zona que contenga la
secuencia del GEN creado por el clon celular X en un momento X de
la MP.
¿ Como procedería el
CCER en la creación del ordenador no
ejecutable?
El CCER deberá trabajar en dos
situaciones distintas:
– una re adaptando el ordenador recibido a
través del virus para luego empaquetar-lo en la
molécula de ADN bicatenario en formación como
un ordenador inhabilitado ejecutable, es decir la
proteína que codifica generara efecto a nivel de
operatividad celular de diferenciación.
- crear el ordenador no
ejecutable para que este de algún modo active el
ordenador anterior en una nueva secuencia iniciada por la CR el
momento exacto donde fue creado por la MP que informo vía
virus al CCER.
¿Como quedarían ambos
ordenadores en una primera instancia?
- Ordenador del virus:
/—secuencia de procedencia o
linea–()–secuencia no gen–/–secuencia gen-/
(): secuencia de bases corta que permite
reconocer la zona ejecutoria del ordenador transportado por el
virus.
- Ordenador ejecutable:
/–secuencia de fase–/–secuencia de
procedencia o linea—-//– secuencia no gen–/–secuencia
gen-/
/—————zona regulatoria
A3——————————//—zona
ejecutoria————————-/
El modelo plantea que la secuencia de fase
es creada por el CCER ya que este tendría la
información genética actualizada total
recibida hasta ahora de la linea por lo cual le seria mas
fácil determinar a través de esa secuencia el
momento exacto en que el ordenador ejecutable debería ser
activado cuando la célula reproductora inicie una nueva
secuencia.
- Ordenador no ejecutable
creado:
/—A1—/——A2—————-//————–A3———————/
A2: secuencia de bases que deberá
reconocer el ordenador no ejecutable anterior para
así activar el ordenador no ejecutable
creado colocando la secuencia B en el punto
//.
A3: secuencia de bases que al ser
transcrita generara un ARNi que posibilitara la activación
del ordenador ejecutable anterior.
Pero hasta ahora hablamos de un
ordenador.
En una Fase es muy posible que sean varios
los virus que lleguen al CCER perteneciendo a distintas lineas
por lo cual es muy probable que se creen varios ordenadores
no ejecutables que tendrán igual A2, pero que
diferirán en A3.
Este grupo de ordenadores no ejecutables
con igual A2 definen un CLUSTER BIOLÓGICO NO
EJECUTABLE. Este Cluster biológico No Ejecutable, en una
nueva secuencia de vida, definirá en el momento justo una
FASE en cada linea donde este.
Esta creación realizada por el CCER
sera probada por la célula reproductora una vez que sea
eliminada he inicie una nueva secuencia. Probando se hará
funcional la creación y si es necesario la célula
reproductora re adaptara el o los ordenadores que generen un
conflicto.
¿Como queda formado un ordenador no
ejecutable?
/—-A1—-/—–A2———–//———A3———–/——-A4?————-/
/—–zona
regulatoria——–//———–zona
ejecutoria——————–/
/——————————-//—zona
no gen E1—-/—zona gen ? G——/
Un ordenador no ejecutable siempre posee
una zona regulatoria.
Todos los ordenadores no ejecutables
comienzan con A1 (secuencia de especie).
Todo ordenador no ejecutable posee la zona
ejecutoria no gen E1.
La zona E1 sirve de reconocimiento de otro
ordenador que puede ser no ejecutable o ejecutable de
diferenciación celular.
Un ordenador no ejecutable podría
llegar a tener una zona gen G en la zona ejecutoria, pero la
proteína que codifica solo actuaria a nivel de ordenadores
ejerciendo algún tipo de regulación estimuladora o
inhibitoria.
Un ordenador no ejecutable si no posee en
el punto // la secuencia B el mismo esta
in-habilitado.
Un ordenador no ejecutable si posee en el
punto // la secuencia B el mismo esta activado. Un ordenador no
ejecutable activado siempre esta expuesto al Sistema
Biológico transcripcional que en este caso sera SBT etapa
embriogenica.
Si varios ordenadores no ejecutables
activos pertenecientes a un cluster solo reconocen con la zona E1
otros ordenadores no ejecutables a los cuales activan tras la
división celular las dos células hijas no
habrán variado su operatividad en relación a la
célula madre.
Si varios ordenadores no ejecutables
activos pertenecientes a un cluster ademas de reconocer con la
zona E1 otros ordenadores no ejecutables reconoce y activa
ordenadores ejecutables de diferenciación celular tras la
división una o ambas células hijas
habrán cambiado bruscamente su operatividad en
relación a la célula madre.
Estos ordenadores ejecutables de
diferenciación celular activos podrían tener efecto
regulatorio sobre la transcripción de ciertos ordenadores
no ejecutables activos.
Un ordenador no ejecutable podría
tener en la zona ejecutoria no gen varias secuencias repetitivas
E1 iguales separadas por una secuencia corta
vinculante.
/—–A1—-/——–A2———–//——–A3—-/Av/—-A3—–/Av/—–A3—–/Av/—etc./
Esta situación podría haber
sido utilizada por la evolución para asegurar en
algún punto de la secuencia que la orden que portan por su
importancia si o si se cumpla.
Definamos en nuestro modelo CLUSTER
BIOLÓGICO MADRE:
CBM: conjunto finito de CLUSTER
BIOLÓGICOS NO EJECUTABLES que son creados por el CCER y la
CR con el fin de lograr un sistema operativo que
tendrá las ordenes necesarias para generar una secuencia
de hechos que posibiliten concretar la etapa:
Programa de Aplicación Etapa
embriogenica.
Ley genética: los cluster
biológicos no ejecutables son activados o in-habilitados
exclusivamente por cluster biológicos no ejecutables.
Cuando una célula adquirió en
su genoma la totalidad del programa de aplicación que
portara hasta el final de la vida es porque todos los cluster
biológicos no ejecutables han sido
in-habilitados.
Un ordenador no ejecutable solo
podrá activar un ordenador ejecutable de
diferenciación in-habilitado.
Nunca un ordenador no ejecutable
podrá in-habilitar un ordenador ejecutable de
diferenciación celular, una vez que los activa no se puede
volver atrás.
2- CLUSTER BIOLÓGICOS
EJECUTABLES: cuando la orden genera efecto a nivel celular. Las
encargadas de generar cambios importantes en la operatividad
funcional o metabólica de la célula son las
PROTEÍNAS.
Se clasifican en:
2.1- ACTIVOS PERMANENTEMENTE: no necesitan
del CBM para ser activados aunque si fuese necesario
podrían ser in-habilitados por este en alguna
situación particular.
Estos ordenadores tienen la particularidad
de no generar diferenciación celular; son proteínas
en común a todo tipo de célula diferenciada que
puede generar el cigoto.
Es muy probable que muchos de estos
ordenadores ejecutables activos permanentemente no estén
organizados en cluster biológicos. Muchos ya estaban en la
Célula Base.
Otros han ido apareciendo según
necesidad durante el proceso evolutivo sumándose al camino
genético.
Están agrupados en GRUPOS. Estos son
muy precisos e independientes.
Cada grupo de ordenadores
ejecutables activos permanentemente sufre uno
de los dos procesos regulatorios:
– Auto regulación
– Regulación vía otros
grupos.
En primera instancia podemos hablar de dos
grandes grupos generales:
a- Grupo de ordenadores ejecutables activos
permanentemente de soporte metabólico
básico.
b- Grupo de ordenadores ejecutables
estructurales activos permanentemente: son proteínas
que intervienen en todo el sistema estructural de la
células.
Algunos Grupos de ordenadores ejecutables
activos permanentemente que nos interesan en nuestro
modelo
– GRUPO ADN CÍCLICO
MITOCONDRIAL.
– GRUPO DE ENZIMAS
METABÓLICAS
– GRUPO SISTEMA BIOLÓGICO
TRANSCRIPCIONAL (SBT)
– GRUPO DUPLICACIÓN ADN.
– GRUPO CITOCINESIS
– GRUPO LIMPIEZA Y DEGRADACIÓN DE
PROTEÍNAS, ARN, ETC..
2.2- CLUSTER BIOLÓGICOS
EJECUTABLES IN-HABILITADOS O DE DIFERENCIACIÓN CELULAR:
necesitan del CBM para ser activados. Estos cluster contienen
toda la información genética necesaria para
transformar el Cigoto en todos los clones de células
diferenciadas que conforman el ser humano.
Este proceso se realiza a través de
una secuencia dirigida por el CBM.
Cada clon de células diferenciadas
al final de la Etapa Embriogenica habrá adquirido un
programa de aplicación que portara hasta el final de la
vida.
Los distintos programas de
Aplicación somáticos fueron concebidos en el
CCES y el programa de aplicación sexual en el CCER. A su
vez este ultimo centro seria el encargado de eliminar la
célula reproductora.
Cada paso evolutivo seguramente tuvo
millones de conflictos que no prosperaron, pero la insistencia y
el azar de que el camino genético evolutivo no se
corto dio sus frutos en la maravillosa concepción de la
ESPECIE HUMANA.
Definamos en
nuestro modelo el Sistema Biológico
permanente
-El modelo plantea que el primer Sistema
Biológico de Transcripción Inversa fue
el centromero que junto a una TELOMERASA permitió
transformar los genes en estado libre como ARN en ADN,
empaquetándolos y dando inicio al esqueleto primario de
los futuros cromosomas, ahora en
crecimiento.
Esas hebras simples de ADN que se iban
formando encontraron estabilidad uniéndose a
pequeñas secuencias complementarias a través
de los puentes de hidrógeno, pero este
sistema paliativo tomo protagonismo cuando la
evolución pudo sintetizar la primer ADN
polimerasa.
Con esta encontró un sistema, la
doble hélice, que le permitía acceder a la
duplicación de una manera fácil y efectiva.
La adición de desoxi-ribosa fosfato otorgaría la
fuente de energía en ese proceso.
Hasta este tiempo los genes se incorporaban
en sentido centromero-telomero.
El crecimiento en longitud de la
doble hélice en ese sentido se iba haciendo inestable
por lo cual la evolución debió buscar la forma de
estabilizar la estructura, es ahí donde encuentra la
manera, a través de la incorporación de
las histonas y creación de los
nucleosomas.
Ahora la secuencia de nucleosomas iba
definiendo el esqueleto final de los brazos de los cromosomas en
crecimiento.
La evolución debió ir
colocando las histonas de una manera progresiva a medida que los
ordenadores se incorporaban teniendo como objetivo que las mismas
debían ser creadas de tal forma de hacer funcional el
ordenador en cuestión.
Esta creación debía responder
eficazmente a los Sistemas Biológicos de lectura que
ya evolutiva mente iban apareciendo.
En definitiva, el brazo de un cromosoma
terminaba siendo un cable proteico donde se enrollaba la
secuencia de ordenadores biológicos unidos unos a
otros constituyendo la doble hélice de ADN.
La creación y ubicación de
las histonas debía generar puertas y ventanas en
la doble hélice que le permitieran a los Sistemas
Biológicos de lectura cumplir con sus funciones
permitiendo además el accionar de un sistema de
reconocimiento o regula
torio de expresión de los
ordenadores que también
evolucionaban a la par.
Ese Sistema Regulatorio de expresión
en gran parte fue posible gracias a que la evolución pudo
articular la secuencia de nucleosomas de tal forma de llevarlo
desde la compactación extrema hasta lo que
conocemos como collar de cuentas.
En nuestro modelo a este sistema lo
denominaremos:
SISTEMA BIOLÓGICO DE
CROMATIZACION:
En su versión más
evolucionada es el sistema encargado de introducir las
histonas en la doble hélice post duplicación ADN,
de esta manera produce la cromatina o secuencia de
nucleosomas que constituyen los brazos de los
cromosomas.
Este mecanismo genético es muy
preciso y tras la duplicación del ADN responde a una
serie de patrones de reconocimiento dado por los cuatro pares de
histonas del nucleosoma madre que debe ser duplicado en dos
nucleosomas hijos.
No debe fallar en la colocación de
cada una de las histonas ya que esto podría traer
aparejado una falla en la funcionalidad del ordenador.
Asimismo como veremos más adelante,
en ciertas ocasiones podría tener que cambiar una
histona por otra respondiendo a un cambio en el numero de
bases nitrogenadas del ordenador.
Evolutiva mente hablando cada
histona creada fue concebida a lo largo del tiempo a medida que
fueron requeridas asegurando la funcionalidad del ordenador
almacenado oportunamente como ADN.
Cada histona creada presenta un ordenador
en el ADN que codifica su secuencia de
amino-ácidos.
Seguramente estos ordenadores ejecutables
activos permanentemente forman un grupo muy concreto. En el caso
de que la célula este imposibilitada de
dividirse la síntesis de
estas servirán para algún posible
recambio.
¿ Como estaría formado
el nucleosoma?
Formado
por un núcleo proteico de cuatro
pares de histonas, (H2A,
H2B, H3 y H4), ocho en total, formando una estructura espacial en
la cual la doble hélice está anclada. Cada
octámero de histona está rodeado por 1.7 vueltas
aproximadamente de ADN bicatenario. Dos nucleosomas
consecutivos están separados por una secuencia de ADN
espaciador. Otra histona H1 se extiende sobre la molécula
de ADN fuera de la parte central del nucleosoma. La histona
H1 está relacionada con la condensación
de la cromatina, sin embargo es también parte del
SBN interviniendo activamente en las
distintas cuestiones relacionadas a este. Al sistema se
agregarían ciertas proteínas no
histonas.
UN ORDENADOR BIOLÓGICO
ESTARÍA ANCLADO SOBRE UNA SECUENCIA DE UNO O MAS OCTAMEROS
DE HISTONAS DEPENDIENDO DE LA CANTIDAD DE BASES
NITROGENADAS QUE TIENE LO QUE SE RELACIONA DIRECTAMENTE CON LA
ORDEN QUE CODIFICA.
SISTEMA BIOLÓGICO NUCLEOSOMA (SBN):
ordenador biológico + numero de nucleosomas sobre el
cual apoya.
Porción de cable proteico sobre el
cual se enrolla un ordenador biológico.
Definamos:
Cable proteico: secuencia de octameros de
histona mas la histona H1.
En nuestro cable proteico definiremos el
termino LUGAR como el sito donde se asienta
la Zona Regulatoria de
un Ordenador biológico.
A este sitio lo denominaremos LUGAR
PRINCIPAL.
Definiremos como LUGAR SECUNDARIO a todos
aquellos sitios del cable proteico que expuestos a
moléculas orgánicas pueden sufrir reacciones
químicas que modifiquen la situación espacial del
mismo y por ende la exposición o no a la red
química del LUGAR PRINCIPAL.
El LUGAR PRINCIPAL puede funcionar
como COMANDO:
– COMANDO INTELIGENTE: cuando solo esta
la secuencia de bases A. Al no estar la secuencia B el
ordenador esta in-habilitado.
El comando inteligente es un lugar
fundamental para lograr el reconocimiento de un ordenador por
parte de otro ordenador y así ser activado.
– COMANDO TRANSCRIPCIONAL: una vez activado
el ordenador por el respectivo mecanismo genético el
comando inteligente se transforma ademas en comando
transcripcional pues incorporo en la zona regulatoria la
secuencia de B.
Formado por la secuencia B.
¿COMO SERIAN LOS ANCLAJES ENTRE LOS
ORDENADORES BIOLÓGICOS Y LAS HISTONAS?
Independientemente de la secuencia de bases
nitrogenadas de la doble hélice los anclajes mas comunes
están dados por el grupo fosfato de la doble hélice
y las histonas.
Sin embargo nuestro modelo plantea
que ciertas secuencias de bases de los ordenadores
biológicos generan con la histona un
anclaje mas fuerte y organizado capaces de actuar
como:
-RECEPTORES INTRANUCLEARES
ADN-HISTONA. (RI=ADN-H)
Como se clasifican los RI=ADN-H:
1-PUERTAS: se definen como un RI=ADN-H que
al estar expuesto a la red química permitiría
que algún Sistema Biológico pueda reconocer y tras
una secuencia de ensambles ingresar a la intimidad de la doble
hélice.
A- PUERTAS DE ENTRADA:
A1- RI=ADN-H
transcripcional.
Formado por la secuencia B de un ordenador
mas la histona que llamaremos Histona B.
Función: este receptor al estar
expuesto a la red química permite el accionar del SBT
(factores de transcripción + ARNp) posibilitando la
lectura de la zona ejecutoria del ordenador a través de la
generación del correspondiente ARNm
inmaduro.
A2- RI=ADN-H duplicación
ADN.
Formado por la secuencia R ínter
locus y las respectivas histonas.
Función: este receptor al estar
expuesto a la red química posibilita que el Sistema
Biológico Duplicación de ADN se active generando el
replisoma y posterior duplicación del
ADN.
A3- RI=ADN-H primario.
Formado por la secuencia regulatoria
de un ordenador mas la histona correspondiente.
-RI=ADN-H primario A
inteligente.
Formado por la secuencia A de un ordenador
mas la histona que llamaremos A.
Función: este receptor permite el
reconocimiento del ordenador por otro ordenador.
-RI=ADN-H primario AB doble.
Formado por el RI=ADN-H primario AB
inteligente + RI=ADN-H primario AB
transcripcional
RI=ADN-H primario AB inteligente
Formado por la secuencia A de un ordenador
mas la histona que llamaremos AB
Función: este receptor permite el
reconocimiento del ordenador por otro ordenador.
RI=ADN-H primario AB
transcripcional.
Formado por la secuencia B de un ordenador
mas la histona que llamaremos AB.
Función: este receptor permite la
transcripción del ordenador por el SBT.
B- PUERTAS DE SALIDA:
B1- RI=ADN-H D salida
transcripción.
B2- RI=ADN-H FR salida
duplicación ADN.
2-VENTANAS: se definen como un RI=ADN-H que
al estar expuestos a la red química se ensamblan a un
sistema biológico pero este no puede acceder a la
intimidad de la doble hélice.
- RI=ADN-H secundario.
Formado por una parte de la secuencia de
los intrones y las histonas correspondiente.
Función: a medida que avanza
la ARNp en la transcripción comienza a tener
problemas con la ruta. El modelo plantea que en la
transcripción no se usa una Topoisomerasa. Estos
receptores intra-nucleares al acercarse la ARNp los expone a la
red química lo que produce un ensamble con ciertos
factores de transcripción que automáticamente
re acondicionarían la ruta para que pueda
proseguir.
-RI=ADN-H quiasma.
Formado por una secuencia interlocus mas
las histonas correspondientes.
Función: posibilitar el apareamiento
de las zonas combinantes de dos cromosomas
homólogos.
————————————————————————————————–
————————————————————————————————–
¿Como se produciría
el RECONOCIMIENTO de un ordenador no ejecutable del CBM
por otro ordenador no ejecutable?
¿ QUE ES EN NUESTRO MODELO AL
ARN INTERFERENTE. ARNi ?
ARNi: es una secuencia de bases
nitrogenadas (A-U-C-G) que resulta de la transcripción de
la zona ejecutoria no gen de un ordenador no
ejecutable.
En primera instancia, tras la
transcripción, forma parte del ARNm inmaduro.
Este ARNm puede estar formado por una
secuencia no gen solamente o por una secuencia no gen + la
secuencia gen.
Este en la red química es sometido
al mecanismo de Splicing donde es atacado por diversos sistemas
biológicos.
Supongamos ahora un ordenador no ejecutable
del CBM el cual se encuentra activado y presenta en su zona
ejecutoria solo la secuencia no gen E1
Or1
/—A1—/—–A2—–//—-B—–/———-E1————/
E1= A3+A1
Entonces seria:
Or1
/—A1—/—–A2—–//—-B—-/——A3——-/—A1—/
La ARNp ingresa el el punto // y comienza
la transcripción generando el ARNm inmaduro
correspondiente.
ARNm:
//—-Bc—-/———–A3c———/—A1c—/
Ley genética:
Si la secuencia de
A1= AATCCC
Siempre el final de la secuencia de la zona
ejecutoria no gen de un ordenador no ejecutable del CBM
sera = CCCTAA
Or1
/AATCCC/——A2——//—-B—-/———A3———-/CCCTAA/
ARNm:
//—-Bc—-/———A3c——–/GGGAUU/
Supongamos ahora la siguiente secuencia de
B:
B= AAATAT
Or1
/AATCCC/—-A2——//AAATAT/———A3———-/CCCTAA/
ARNm
//UUUAUA/———A3c———/GGGAUU/
En este caso al no existir zona gen
el ARNm se convierte en ARNi
ARNi=
/UUAGGG/———-A3c———/AUAUUU//
Esta secuencia se unirá en sus
extremos a dos proteínas especificas en el mecanismo de
Splicing generando el:
SISTEMA BIOLÓGICO ARNi:
SBARNi= PROTEÍNA
A1/UUAGGG/——A3c—/AUAUUU//PROTEÍNA B
Supongamos ahora otro ordenador no
ejecutable in-habilitado: Or2:
Or2 /—–zona
regulatoria————//—-zona
ejecutoria—————/
Or2
/AATCCC/——–A3———–//——–E2——-/———G2?—–/
Asignemos-le una secuencia arbitraria a
A3
A3=
/TTTCGCGCTATC/
Or2 /AATCCC /
TTTCGCGCTATC //——–E2——-/—–G2?—-/ Reconocimiento
/————————————–//
SBARNi= PA1-/UUAGGG
/AAAGCGCGAUAG //AUAUUU/-PB
/—A1c—-/——–A3c———- //—Bc—–/
El SBARNi hace un reconocimiento por
complementariedad de bases en el comando inteligente
del Or2.
Esto permite un ensamble entre
el sistema biológico ARNi y el RI=ADN-H
primario A inteligente.
Veamos lo de una manera mas
gráfica:
Este mecanismo genético se produce
en la ETAPA EMBRIOGENICA.
El ordenador no ejecutable 2 se presenta
in-habilitado.
El comando inteligente del Or2 anclado con
la histona A genera el RI=ADN-H primario A inteligente el cual al
ensamblarse en el paso 1 con la PROTEÍNA EMBRIOGENICA E:
PE genera ciertos cambios en la susceptibilidad del
receptor.
El ordenador que codifica la PE se
encuentra en el CBSDC.
Esta PE convierte al receptor en NO
REGULABLE, aumentando la afinidad de este por la Proteína
A1 del SBARNi y por el otro ejerciendo una mayor
exposición a la red química de la secuencia de
bases de A3 para aumentar la efectividad del ensamble por
complementariedad con la secuencia A3c del SBARNi.
La PA1 y la PB se unen al ARNi en el
proceso de splicing generándole al nuevo sistema
Biológico gran estabilidad en la red
química.
En el paso 2 la secuencia A1c del SBARNi se
une por complementariedad a la secuencia A1 del Or2 ayudado por
la PA1 y la PE.
A continuación se unirán
progresivamente la secuencia A3c del SBARNi con la secuencia A3
del Or2 si existe CORRESPONDENCIA entre ambas.
Una vez finalizado el proceso el Or2 ha
sido RECONOCIDO por el SBARNi.
Este reconocimiento permite que la PB
accione generando el paso 3 del mecanismo
genético.
En el paso 3 la PB se ensamblara con el
SISTEMA BIOLÓGICO DE RIBOTRANSFERENCIA INTERFERENTE
ACTIVANTE. SBRIA.
EL SBRIA estará formado por un grupo
de proteínas entre las que debe existir una
TELOMERASA.
Terminada esta secuencia de ensambles de 3
pasos habrá que esperar el MECANISMO GENÉTICO
DE DUPLICACIÓN DE ADN con el cual se concretara la
orden generada por Or1 que produjo el ARNi en
cuestión.
¿Como es activado el Or2
in-habilitado?
El ensamble anterior se mantendrá
hasta que el Mecanismo de Duplicación del ADN
alcance el punto A3E2.
Cuando la Topoisomerasa se acerque al punto
A3E2 de la hebra adelantada choca con el SBRIA, rompe el punto
A3E2 y el SBRIA aprovecha en meter la secuencia B.
El SBRIA al poseer actividad Telomerasa
hace una transcripción inversa de la secuencia de Bc del
SBARNi la cual invierte y la pega al extremo A3 a través
de una Ligasa. El otro extremo de B lo pega a E2.
La ADNp que viene replicando la hebra
adelantada cuando llega al punto A3B genera la secuencia de
B complementaria y prosigue con la replicacion de E2.
Ahora la secuencia de B quedo incorporada
en el Or2 y estabilizada por su secuencia complementaria en la
hebra hija del Or2.
El ensamble entre el SBARNi y el SBRIA
cumplió la orden y se desprende.
CONCLUSIÓN: del proceso de
división celular obtuvimos 2 células
hijas.
Célula 1: el Or2 fue activado
agregando al comando inteligente el comando de
transcripción.
Ahora dicho comando estará expuesto
o no al Sistema Biológico Transcripcional según las
necesidades de la célula 1. De estar expuesto la zona
ejecutoria del ordenador se transcribirá generando una
orden que es volcada a la red química.
Célula 2: donde el Or2 sigue
in-habilitado.
A TRAVÉS DEL MECANISMO
GENÉTICO DE RIBOTRANSFERENCIA INTERFERENTE ACTIVANTE Y EL
DE DIVISIÓN CELULAR SE CONSIGUIÓ DIFERENCIAR LAS
DOS CÉLULAS HIJAS.
Después de la duplicación del
ADN las dos nuevas doble hélices hijas generadas son
atacadas por el SISTEMA BIOLÓGICO DE
CROMATIZACION.
Este ira metiendo las histonas para formar
en cada doble hélice la nueva secuencia de nucleosomas del
nuevo cromosoma.
En la doble hélice hija donde
el Or2 se activo la HISTONA A SERA CAMBIADA POR
LA HISTONA AB.
Esta se ensamblara ahora no solo con el
comando inteligente del Or2 sino también con el
comando transcripcional formando ahora lo que
llamaremos: RI=ADN-H primario AB doble
Este nuevo receptor intranuclear
estará formado por dos comandos:
-Comando inteligente: formado por la
secuencia A1-A3 mas la histona AB.
-Comando transcripcional formado por la
secuencia B y la histona AB.
Dentro de la Etapa Embriogenica
existirá la PROTEÍNA EMBRIOGENICA E1- PE1 que
tendrá gran afinidad por el comando inteligente del
RI=ADN-H primario AB doble.
Esta PE1 al ensamblarse con el comando
generara una mayor afinidad por la PA1 del SBARNi y aumentara las
exposición a la red química de la secuencia de
bases A3 para incrementar la posibilidad de ensamble por
complementariedad de la secuencia A3c del SBARNi en
cuestión.
Por otro lado el COMANDO TRANSCRIPCIONAL
permanecerá expuesto continuamente a la red química
y con una gran afinidad por el FACTOR DE
TRANSCRIPCIÓN INICIADOR ETAPA EMBRIOGENICA el cual
dará inicio rápidamente a la secuencia del SISTEMA
BIOLÓGICO TRANSCRIPCIONAL ETAPA EMBRIOGENICA que
transcribirá el ordenador en
cuestión.
La velocidad de transcripción de
este sistema Biológico es altísimo lo que
posibilita en una unidad de tiempo multiplicar la orden y por
consiguiente aumentar la eficacia en su
ejecución.
Mientras el Or2 es transcrito por el SBTee
podría ocurrir que un SBARNi se ensamble positiva-mente
con el comando inteligente.
Esto permitirá el acceso del
SISTEMA BIOLÓGICO DE ROBOTRANSFERENCIA
INTERFERENTE IN-HABILITANTE. (SBRII).
El SBRII contara entre otras
proteínas, con la PROTEÍNA INHIBITORIA
(PI).
Solo cuando la PI se una al SBRII se
detendrá automáticamente la
transcripción.
Ahora sera cuestión de esperar el
mecanismo de duplicación de ADN para que se produzca la
ejecución de la orden que en este caso sera la de
in-habilitar nuevamente el Or2.
¿Como es in-habilitado el
Or2?
La PI es fundamental en el SBRII. Esta es
la ultima en ensamblarse al SBRII y la encargada de frenar
automáticamente la
transcripción del Or2. Mientras no se
una la PI al SBRII el Or2 seguirá
transcribiéndose.
El ordenador que codifica esta
proteína , en nuestro modelo, esta ubicado en el CBSDC, es
una proteína de la etapa embriogenica y fundamental
en el mecanismo de in-habilitación de los ordenadores del
CBM.
El ordenador que codifica la PE1
también se encuentra en el CBSDC.
Aparte de las funciones nombradas
anteriormente la PE1 tras la duplicación del ADN, cuando
las dos células hijas vuelven a tener el Or2
in-habilitado, se une en el mecanismo de cromatizacion
al RI=ADN-H primario A inteligente, generando
transitoriamente con la histona A y la PI un COMPLEJO
PROTEICO IN-HABILITANTE DEL Or2.
Este tiene como función impedir
que el Or2 vuelva a activarse mientras dure la etapa
embriogenica.
Es importante entender lo
siguiente:
Cuando hablamos de histona A e histona AB,
no estamos hablando de una histona en particular sino de
un
PATRÓN DE RECONOCIMIENTO generado
por una o mas histonas pertenecientes al octamero de
histonas.
El mecanismo de in-habilitación del
Or2 se produce cuando la Topoisomerasa alcanza el punto A3B y en
un accionar conjunto con el SBRII+PI eliminan de la doble
hélice las secuencia de B y Bc en el Ordenador
Biológico 2.
Ahora las dos células hijas
tendrán el Or2 In-habilitado.
CONCLUSIÓN: el mecanismo de
activación post inhibición en un mecanismo
secuenciado.
EJEMPLO 1:
1- un ordenador no ejecutable del CBM
in-habilitado es activado.
La activación se da en dos
generaciones de células:
-Primera: se forma el COMPLEJO DE
ACTIVACIÓN: Ordenador in-habilitado +SBARNi +
SBRIA = CÉLULA MADRE 1.
– Segunda: tras la división
celular:
CÉLULA HIJA 1: ORDENADOR NO
EJECUTABLE activado.
CÉLULA HIJA 2: ORDENADOR NO
EJECUTABLE in-habilitado
2- tras ser activado luego es
in-habilitado.
la in-habilitación se da en dos
generaciones de células:
-Primara: CÉLULA HIJA 1: se forma EL
COMPLEJO DE IN-HABILITACIÓN: ordenador activado +
SBARNi + SBRII+PI
-Segunda: tras la división
celular:
CÉLULA HIJA 1 A: ORDENADOR NO
EJECUTABLE inhabilitado.
CÉLULA HIJA 1 B: ORDENADOR NO
EJECUTABLE inhabilitado.
3- al se in-habilitado no puede volver a
ser activado.(Complejo Proteico In-habilitante)
En esta secuencia de divisiones celulares
hubo una activación y una in-habilitación de un
ordenador no ejecutable pero sin embargo ninguna de la tres
células: CH2, CH1A y CH1B han cambiado su
operatividad.
Se define una FASE en una
secuencia de divisiones celulares al clon de células
generadas que presentan la misma operatividad.
EJEMPLO 2:
Supongamos ahora el siguiente
Ordenador ejecutable in-habilitado:
/–secuencia de fase–/–secuencia de
procedencia o linea—-//– secuencia no gen–/–secuencia
gen-/
/—————zona regulatoria
———————————–//—zona
ejecutoria———————–/
En un punto de la secuencia el CBM activa
un ordenador no ejecutable que posee en su zona ejecutoria no gen
una secuencia de bases que reconoce un ordenador ejecutable.
(SROE)
/—–A1—–/———–A3———–//—-B—–/———-SROE————–/
Esta SROE se corresponde con la zona
regulatoria del ordenador ejecutable anterior. Es
decir:
SROE = /—secuencia de procedencia o
linea—/–secuencia de fase–/
El ordenador no ejecutable al ser
transcripto genera el siguiente ARNi:
ARNi =
//—Bc—-/—(secuencia de procedencia o
linea)c–/—(secuencia de fase)c—/
En la red química este ARNi es
madurado a través de ciertas proteínas que lo
convierten en el respectivo SBARNi:
Este SBARNi se ensambla al ordenador
ejecutable anterior, luego procede el SBRIA y tras la
división celular una de las dos células hijas
habrá activado el ordenador ejecutable adquiriendo una
operatividad distinta a la célula madre.
Esta célula hija que vario su
operatividad en relación a la célula madre define
una linea.
Se define una LINEA en una
secuencia de divisiones celulares al clon de células
generadas que presentan una operatividad en común pero
distinta a la de la célula que las origino. Es decir este
clon de células habrá activado uno o mas
ordenadores ejecutables o de diferenciación
celular.
LEY GENÉTICA: TODO MECANISMO DE
ACTIVACIÓN O IN-HABILITACIÓN DE ORDENADORES NO
EJECUTABLES NECESITA 2 GENERACIONES DE CÉLULAS PARA
EJECUTAR LA ORDEN.
EN LA PRIMERA GENERACIÓN SE FORMAN
LOS ENSAMBLES CORRESPONDIENTES SEGÚN SEA
ACTIVACIÓN O IN-HABILITACIÓN.
EN LA SEGUNDA GENERACIÓN LAS
CÉLULAS HIJAS HABRÁN EFECTIVIZADO LAS ORDENES
GRACIAS AL MECANISMO DE DUPLICACIÓN DEL ADN.
DEPENDIENDO EN QUE HEBRA ESTE EL ORDENADOR
LAS ORDENES ACTIVANTES ESTARÁN EL LA CÉLULA HIJA 1
O 2 .
UN ORDENADOR NO EJECUTABLE SOLO PUEDE
ACTIVAR UN ORDENADOR EJECUTABLE O DE DIFERENCIACIÓN
CELULAR.
ES DECIR LOS ORDENADORES DE
DIFERENCIACIÓN CELULAR SON TERMINALES, AL SER ACTIVADOS LA
SITUACIÓN NUNCA MAS PUEDE SER ALTERADA.
Definamos la siguiente
nomenclatura:
CÉLULA 1: célula 1
CBM1H1 =
CBM1—B—CBM2—G1
OE1H2 =
SROE1–ZONA EJECUTORIA
CBM1H1: ordenador no ejecutable 1 ubicado
en la hebra 1
OE1H2: ordenador ejecutable 1 ubicado
en la hebra 2.
CBM1: secuencia de reconocimiento del
ordenador no ejecutable 1.
B: ordenador activado
CBM2: secuencia no gen (ARNi) del ordenador
no ejecutable 1
SROE1: secuencia de reconocimiento del
ordenador ejecutable ubicado en la hebra 2.
//: ordenador in-habilitado.
EJEMPLO 1
————————————————————————————————–
CÉLULA 1
ORDENADORES ACTIVOS:
ORDENADORES RECONOCEN ARNi
A CBM1H1 = CBM1—B–CBM2H1
A: CBM2H1 =
CBM2–//–ZE
B CBM1H1 = CBM1—B–CBM3H2
CBM3H2
= CBM3–//–ZE
C CBM1H1 = CBM1—B–SROE1H2
OE1H2
= SROE1-//-ZE
D CBM1H1 =
CBM1—B–CBM1H1 I:
A,B,C,D
————————————————————————————————–
A: ordenes de activación I:
ordenes de in-habilitación ZE: zona ejecutoria
CÉLULA HIJA 1
CÉLULA HIJA 2
CBM2H1 = CBM2–B–ZE
CBM3H2 =
CBM3–B–ZE
OE1H2 =
SROE1-B-ZE
————————————————————————————————-
Analizamos el ejemplo 1:
El CBM1 esta formado
por 4 ordenadores no ejecutables del los
cuales el C activa uno o varios ordenadores ejecutables 1 que
están en la hebra 2.
El A y B activan uno o varios ordenadores
no ejecutables del CBM2 en la hebra 1 y CBM3 en la hebra
2.
La célula hija 1 tiene la misma
operatividad que la célula 1 sin embargo la célula
hija 2 cambio rotundamente la operatividad generando una
linea.
El ordenador no ejecutable D del
CBM1 es AUTO VINCULANTE.
Auto Vinculante significa que la secuencia
de bases no gen de la zona ejecutoria reconoce vía ARNi
al comando inteligente de los ordenadores pertenecientes al
mismo CBM1.
Este ordenador no ejecutable auto
vinculante podría tener en la zona ejecutoria no gen
varias secuencias generadoras de ARNi. Por ejemplo:
D CBM1H1 =
CBM1—B—CBM1–CBM1–CBM1–CBM1
¿ Como pueden los ordenadores del
CBM1 generar activaciones antes de ser in-habilitados en la fase
G1 del ciclo celular sin fallar?
La evolución pudo superar este
conflicto a través del CBSDC y el SBT etapa
embriogenica.
Con el CBSDC modula el tiempo de la fase G1
y con el SBTee aumenta la transcripción de los
ordenadores activos aumentando el numero de los ARNi .
Tras la división celular, cuando
comienza la Fase G1 de la Célula 1, los ordenadores del
CBM1 al estar activos son atacados inmediatamente por el SBTee el
cual comienza la transcripción generando cantidades de
ARNi.
Estos generan tanto los ensambles
activantes como los in-habilitantes.
Sin embargo, los in-habilitantes siguen
generando la transcripción del ordenador hasta tanto se
una al SBRII la PROTEÍNA I (PI).
Al ser sintetizada por el CBSDC, este
comenzara la transcripción del ordenador de la PI ya
casi llegando al final de la Fase G1, en el tiempo mas
cercano posible al comienzo de la duplicación del
ADN.
Con esta secuencias de hechos en la fase G1
y gracias al CBSDC la evolución se aseguro que en la etapa
embriogenica todas las ordenes que deberían ser ejecutadas
se ejecuten sin posibilidad de fallar.
A esto debemos agregar el hecho de que en
cada punto de la secuencia las ordenes están por
duplicado, la materna y la paterna.
EJEMPLO 2
————————————————————————————————–
CÉLULA HIJA 1
ORDENADORES ACTIVOS
ORDENADORES RECONOCEN
ARNi
A CBM2H1 = CBM2–B–CBM3H2
A:
CBM4H1 = CBM4–//–ZE
B CBM2H1 = CBM2–B–SROE1H2
CBM3H2 = CBM3–//—ZE
C CBM2H1 = CBM2–B–CBM4H1
SROE1H2 = SROE1-//–ZE
————————————————————————————————–
CÉLULA HIJA 1-1
CÉLULA HIJA
1-2
CBM4H1 = CBM4–B—ZE
CBM3H2 = CBM3–B–ZE
CBM2H1 = CBM2–B–CBM3H2
SROE1H2 = SROE1-B-ZE CBM2H1 =
CBM2–B–SROE1H2
CBM2H1 =
CBM2–B–CBM4H1
————————————————————————————————–
EJEMPLO 3
————————————————————————————————–
CÉLULA HIJA 1-1
ORDENADORES ACTIVOS
ORDENADORES RECONOCEN
ARNi
A CBM2H1 = CBM2–B–CBM3H2
A: CBM5H1
= CBM5–//–ZE
B CBM2H1 = CBM2–B–SROE1H2
CBM3H2 = CBM3–//–ZE
C CBM2H1 =
CBM2–B–CBM4H1
SROE1H2 =
SROE1-//-ZE
D CBM4H1 =
CBM4–B–CBM2H2
I: A,B,C,D,E.
E CBM4H1 =
CBM4–B–CBM5H1
————————————————————————————————–
CÉLULA HIJA 1-1-1
CÉLULA HIJA
1-2-2
CBM5H1 = CBM5–B–ZE
CBM3H2 = CBM3–B–ZE
SROE1H2 =
SROE1-B-ZE
————————————————————————————————–
Los ordenadores del Genoma Humano fueron
concebidos en la red química, empaquetados en el ADN y
luego enrollados en el cable proteico para formar los
cromosomas.
Pensemos lo siguiente: en el cuerpo humano
los distintos clones diferenciadas se agrupan formando
órganos. Estos son independientes, sin embargo a
través de la sangre se comunican usando un LENGUAJE por
medio de MOLÉCULAS ORGÁNICAS que le permiten
trabajar armónicamente en post de la MASA PLURICELULAR
TOTAL.
Lo mismo ocurriría en el
núcleo de las células; los ordenadores
estarían agrupados de manera independiente utilizando un
LENGUAJE de comunicación entre ellos a través
de MOLÉCULAS ORGÁNICAS.
A grandes rasgos en nuestro modelo nos
interesan los siguientes grupos:
CBM: este grupo esta formado por todos los
ordenadores no ejecutables in-habilitados pertenecientes al
sistema operativo que posibilitan el mecanismo de
diferenciación celular.
ORDENADORES EJECUTABLES DE
DIFERENCIACIÓN CELULAR: este grupo esta formado por todos
los ordenadores ejecutables in-habilitados que son activados
progresivamente en la secuencia de la vida por el CBM.
GRUPO ADN: este grupo esta formado por
todos los ordenadores que intervienen en el proceso de
duplicación del ADN.
Para que se produzca la duplicación
del ADN es necesario en un principio de cuatro grupos de
ordenadores con funciones especificas:
-Grupo 1 duplicación ADN:
formado por todos los ordenadores encargados de sintetizar
todas las proteínas e histonas estructurales necesarias en
el Proceso de Cromatizacion post duplicación
ADN.
– Grupo 2 duplicación ADN: formado
por todos los ordenadores encargados de sintetizar las
proteínas y enzimas encargadas tras la duplicación
del ADN de introducir en las dos doble hélice hijas las
histonas necesarias para formar la secuencia de nucleosomas que
darán lugar a los nuevos cromosomas.
A este sistema biológico lo
denominaremos: SB de CROMATIZACION.
– Grupo 3 duplicación ADN: formado
por los ordenadores encargados de sintetizar las proteínas
y enzimas
que forman parte del Sistema
Biológico de Duplicación ADN (SBD-ADN).
– Grupo 4 iniciador duplicación ADN:
ordenador encargado de sintetizar la PROTEÍNA R
(PR). Esta proteína seria la encargada de reconocer y
romper la secuencia de bases interlocus R posibilitando el
ensamble secuenciado de las proteínas y enzimas del grupo
3 hasta formar el replisoma el cual da inicio a la
duplicación.
Este GRUPO ADN de ordenadores es el que en
la CÉLULA BASE permitía la duplicación
sin ningún tipo de sincronizacion, simplemente se
producía.
SBT: este grupo esta formado por todos los
ordenadores encargados de sintetizar las proteínas y
enzimas del Sistema Biológico Transcripcional.
Estaría formado por:
-Factores de
Transcripción
– ARN polimerasas.
Los factores de transcripción son un
grupo de proteínas encargadas de reconocer el comando
transcripcional B (Promotor) expuesto a la red química
preparando espacialmente el terreno para facilitar el ingreso y
accionar de las ARN polimerasas. Estos Factores de
transcripción actuaran también a lo largo de
toda la ruta re-acondicionando-la a medida que avanza la
ARNp.
En la CÉLULA BASE se genero un
SBT basal el cual debió ser mejorado por la
evolución para cumplir eficazmente con ciertas
situaciones. Una de ellas es la etapa embriogenica.
Los ordenadores ejecutables
permanentemente activos que componen el grupo tienen un comando
transcripcional REGULABLE.
El modelo plantea que son AUTO-REGULABLES,
es decir, cuando en la red química disminuye la
concentración de algún factor estos ordenadores
expondrán los comando de transcripción a la red
química para ser transcrito por el SBT.
Entonces: el SBT transcribe ordenadores que
sintetizan SBT cuando en la red química disminuye la
concentración de alguno de sus integrantes.
Por otro lado es muy probable que estos
factores sean muy resistentes a la acción
catalítica.
Para la etapa embriogenica, la
evolución creo un grupo de ordenadores que ubico en el
CBSDC y que sintetizan lo que llamaremos: FTR: factores de
transcripción regula-torios.
La función de los FTR es la de
integrarse al SBT basal para convertirlo en SBTee.
Estos FTR se irán ensamblando en la
secuencia de la transcripción a los demás factores
según corresponda generando una mayor velocidad de
transcripción por parte de la ARNp y por consiguiente
generara una mayor cantidad de moléculas de ARNm inmaduro
en una unidad de tiempo que el SBT basal en esa misma
unidad.
CBSDC: formado por un grupo de ordenadores
no ejecutables in-habilitados (es decir las ordenes que portan
tienen efecto a nivel de ordenadores)
Todos los ordenadores que lo componen
están in-habilitados y dependen del CBM para su
activación.
Estos ordenadores lo podemos dividir en dos
sub-grupos:
-CBSDC-EE: cluster biológico
sincroniza la división celular etapa embriogenica: en esta
etapa servirá de nexo entre el CBM y el GRUPO
ADN.
Su función sera la de darle al CBM
las herramientas que le permitan incrementar en un 100 % la
eficacia en la ejecución de las ordenes generadas por
el.
¿Que tipo de proteínas
sintetizan los ordenadores del CBSDC-EE?
En nuestro modelo las denominaremos:
PROTEÍNAS REGULADORAS CBSDC-EE
Existen dos grandes grupos con objetivos
diferentes:
1- las que actúan sobre el sistema
biológico nucleosoma exponiendo a la red química
los diferentes comando para que actúen sobre estos los
respectivos sistemas biológicos.
En este caso las llamaremos :
PER:
proteínas embriogenicas regulatorias
2- actúan sobre los SBT aumentando
la velocidad de la transcripción.
FTR:
factores de transcripción regulatorios
¿Como estarán formados estos
ordenadores?
Supongamos un ordenador no ejecutable del
CBSDC-EE y que esta activo:
/———————zona
regulatoria—————/———zona
ejecutoria————-/
/—A1—/——————-A2———//—-B—–/———zona
ejecutoria————-/
El modelo plantea que existen dos tipos de
Histonas:
-Histonas Inteligentes: son aquellas
histonas que tienen áreas en la estructura espacial
proteica que anclan
con ciertas secuencias de bases
especificas de la doble hélice generando los
receptores intranucleares ADN-histona. Dicho de otra manera: una
secuencia de bases X meterá en el mecanismo de
Cromatizacion una histona inteligente X la cual tendrá un
área tridimensional de amino-ácidos en su
estructura espacial que anclara con dicha secuencia de
bases.
Si por algún motivo esa secuencia de
bases X cambia por una secuencia Y, ahora la histona X dejara de
tener afinidad por la secuencia de bases y sera reemplazada por
otra histona inteligente que si tenga afinidad.
-Histonas Estructurales: son las histonas
que estructuran espacialmente los octameros de histonas
anclándose a las histonas inteligentes.
Estas histonas estructurales
anclarían con la doble hélice a través de
los grupos fosfatos de la misma.
Por otro lado ciertos estímulos
químicos en los lugares secundarios podrían alterar
la estructura global del nucleosoma generando una mayor o menor
exposición a la red química del lugar
principal.
Volvamos al ordenador que estábamos
analizando anteriormente:
Zona regulatoria = A +
B
A: secuencia de bases de reconocimiento del
ordenador.
B: secuencia de bases de activación
del ordenador.
A = A1 + A2
A1: secuencia de re-conocimiento de
especie
A2: secuencia de reconocimiento de cluster
= A2C + A2H
A2:
/————A2C—————–/—A2H—-//
Cuales serian las secuencias de
reconocimiento de histonas en el lugar principal:
A1: secuencia de reconocimiento de
histona
A2H + B: secuencia de reconocimiento
de histona.
LEY GENÉTICA: TODOS LOS CLUSTER
BIOLÓGICOS QUE FORMAN PARTE DEL CBM POSEEN DISTINTAS
SECUENCIAS DE BASES EN A2C PERO SIEMPRE LA MISMA SECUENCIA DE
BASES EN A2H.
El comando inteligente o transcripcional de
todos los ordenadores del CBM son no regulables, es decir
siempre están expuestos a la red química
permitiendo el acceso al sistema biológico que
corresponda.
Esto es debido a que las secuencias de A1 y
A2H + B se unen a histonas inteligentes que permiten junto a
ciertas proteínas embriogenicas reguladoras la
exposición continua de los comandos a la red
química.
En el caso del CBSDC-EE, no todos los
ordenadores que lo componen poseerán en la secuencia de
bases A2 la secuencia A2H.
Entonces existirán dos tipos de
ordenadores:
-Los ordenadores que poseen la
secuencia A2H: estos al ser activados presentaran la secuencia
A2H + B
que se unirá a la histona
inteligente correspondiente. Esto permitirá que el comando
transcripcional de estos ordenadores siempre este expuesto al
SBTee.
Este seria el caso de las siguientes
PROTEÍNAS REGULADORAS: PE, PE1, PB, PA1, FTR, entre
otras.
– Los ordenadores que no poseen la
secuencia A2H:
A = A1 + A2
A2:
/————–A2C———–/—–A2Hx——/
Cuando el ordenador es activado, en el
mecanismo de cromatizacion, las secuencia de bases A2Hx +
B
reconocen una histona diferente a la que
reconocía la secuencia A2H + B.
El comando de transcripción de este
ordenador es ahora REGULABLE, la exposición o no del
comando a la red química dependerá ahora de
ciertas proteínas o enzimas.
Este seria el caso de la PI entre
otras.
El hecho de que el ordenador de la PI sea
regulable le permite al CBM tener el tiempo necesario para
asegurar las ordenes activantes o in-habilitantes a través
de los SBARNi y poder cuando lo desee exponer a la red
química el comando de transcripción del ordenador
de la PI para que así sea transcrita y
sintetizada.
Por otro lado le permitiría al CBM
adelantar o retrasar el mecanismo de duplicación del ADN
dentro de la FASE G1:
– Adelantaría la duplicación
del ADN si el CBM actúa directamente sobre el GRUPO
ADN.
– Retrasaría la duplicación
del ADN si el CBM actúa usando como intermediario al CBSDC
y este sobre el GRUPO ADN.
Antes de proseguir definamos nuevos
conceptos:
ORDENADORES VINCULANTES: son vinculantes
cuando poseen en la zona ejecutoria una secuencia no gen que
vía ARNi reconoce la zona regulatoria de otros
ordenadores.
ORDENADORES NO VINCULANTES: son no
vinculantes cuando no poseen en la zona ejecutoria una secuencia
no gen que reconozca otro ordenador.
ORDENADORES AUTO VINCULANTES: son auto
vinculantes cuando poseen en la zona ejecutoria una secuencia no
gen que vía ARNi reconocen la zona regulatoria de los
ordenadores del mismo cluster que genero el ARNi.
LEY GENÉTICA: LOS ORDENADORES QUE
COMPONEN EL CBSDC-EE SON NO EJECUTABLES Y SON ACTIVADOS I/O
IN-HABILITADOS POR EL CBM, SON NO VINCULANTES Y SI POSEEN EN LA
ZONA EJECUTORIA LA SECUENCIA NO GEN, ESTA ES DE TIPO
E2.
-CBSDC-PA: cluster biológico que
sincroniza la división celular programa de
aplicación:
Cuando finaliza la etapa embriogenica,
todos los ordenadores del CBM y CBSDC-EE habrán sido
in-habilitados; en este punto todas las células se
habrán diferenciado y por ende adquirido el programa de
aplicación que portaran hasta el final de la
vida.
Sin embargo, cada clon diferenciado, antes
de que la secuencia se cierre el CBM activara en cada uno de
ellos según el clon un grupo de ordenadores que formaran
el CBSDC-PA.
La función de este grupo de
ordenadores agrupados en el CBSDC-PA sera la de permitir o no el
acceso de la célula diferenciada a la división
celular.
– Si permite el acceso es porque los
ordenadores del CBSDC-PA están habilitados y la
exposición o no de estos al SBT dependerá de
estímulos extra-celulares sujetos a la operatividad de la
célula en cuestión.
– Si no permite el acceso es porque la
evolución determino que la operatividad especifica
que logro para ese clon no funcionara si la
célula accede a la división celular.
Estos diferentes CBSDC-PA estarían
compuestos por ordenadores no ejecutables in-habilitados que son
activados en la secuencia por el CBM y pasaran a formar parte de
los distintos programas de aplicación
de las células diferenciadas que
portaran hasta el final de la vida.
————————————————————————————————–
PATRONES DE RECONOCIMIENTO GENERADOS POR
LAS SECUENCIAS DE BASES NITROGENADAS EN LA DOBLE
HÉLICE.
Ciertas Secuencias de bases nitrogenadas
que forman las dos cadenas complementarias del ADN generan
patrones de reconocimiento que son reconocidos por diferentes
efectores.
En primera instancia, ciertas secuencias
reconocen ciertas áreas de las histonas inteligentes
generando lo que llamamos RI=ADN-H.
Estos receptores intranucleares generan
puertas y ventanas sobre el Sistema biológico nucleosoma
que al estar expuestos a la red química son reconocidos
por diferentes sistemas biológicos transitorios,
como el SBT o el SBD-ADN entre otros.
Por otro lado, la transcripción
genera ARNm inmaduro el cual es sometido al mecanismo de Splicing
generando una o varias moléculas de ARNm
maduro.
Las diferentes proteínas y enzimas
que intervienen en el mecanismo de splicing actúan
reconociendo ciertas secuencias de bases o codones del ARNm
inmaduro.
El ARN de transferencia reconoce un codon
del ARNm maduro con el cual comienza la síntesis de
la cadena polipeptidica y otro codon especifico sera el encargado
de detener la síntesis. Luego cada amino-ácido que
es metido en la cadena polipeptidica depende de un codon
especifico que reconoce el ARNt.
Ley genética: los ordenadores
del genoma humano son los que codifican la
información genética sin embargo
la funcionalidad operativa para levantar la orden y
ejecutarla en el momento justo es lograda gracias a los
innumerables sistemas biológicos creados por la
evolución que accionan cuando están en la red
química y reconocen un patrón de reconocimiento
especifico.
Este accionar produce una secuencia
de hechos que se vinculan con otras secuencias a través
de procesos regulatorios. Estos procesos regulatorios
deberán poner en la red química el sistema
biológico cuando lo necesite la célula y exponer en
simultaneo el patrón de reconocimiento.
Esto jamas se detiene y pasa de un
punto a otro gracias al juego entre patrones de
reconocimiento y efectores. Estos son creados por la
evolución a través de combinaciones
espontaneas entre moléculas gracias al metabolismo
concebido en la célula base que proporciona energía
a través de mediadores químicos.
Por otro lado la evolución
debió ordenar la información
genética contenida en los programas de
aplicación que eran gestados por las crecientes
células del CCES de las masas pluricelulares creando una
secuencia a través de un sistema operativo que
levante la orden y la ejecute en el momento justo de
vida biológica de la masa. Este SO en un momento se
cerrara y dejara librada la continuidad de vida de
la masa a los programas de aplicación y su
vinculación entre ellos.
Estos por si solos con el tiempo y en su
relación con el medio ambiente no tienen otra posibilidad
que la de ir claudicando paulatinamente por diversos factores
terminando inminente-mente en una falla que no puede superar la
masa pluricelular produciendo la muerte de la misma.
El ENVEJECIMIENTO NO ES PRODUCIDO POR UN
MECANISMO GENÉTICO, es producto de una falla
paulatina de los programas de aplicación en su
relación con el medio ambiente.
Todo comenzó con la CÉLULA
BASE pero los diferentes programas de aplicación que
fueron gestados por el CCES y estructurados por el CCER y la CR a
través del Sistema operativo o CBM junto a los
innumerables sistemas biológicos que hicieron funcional el
proceso delimitaron diferentes CAMINOS EVOLUTIVOS
GENÉTICOS que dieron origen a las DISTINTAS
ESPECIES.
No todos los Caminos Evolutivos
Genéticos resolvieron los interrogantes de LA
NECESIDAD DE de la misma manera por consiguiente en cada
caso el CCER y la CR debieron crear un sistema operativo
diferente acorde a los diferentes programas de aplicación
provenientes del CCES.
Muchos por diversos factores no prosperaron
y claudicaron, otros se estancaron en algún punto y otros
aun hoy siguen evolucionando gracias a la versatilidad de los
programas de aplicación.
Los conflictos genéticos no siempre
son superados y la especie puede desaparecer.
Cuando hablamos de LA NECESIDAD DE nos
referimos a:
La necesidad de: protegerse del medio
ambiente
La necesidad de: conseguir alimento del
medio ambiente.
La necesidad de: permanecer en el tiempo y
reproducirse.
La necesidad de: eliminar los desechos del
metabolismo celular; etc, etc, etc.
esta teoría continua ya que hay
muchísimas cuestiones que debo tratar.
Autor:
Oscar Horacio Croatto
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